Музей «Астраханский кремль» был открыт в 1974 году, а в 1980 стал филиалом АГОИАМЗ. Отреставрированные памятники архитектуры астраханского кремля еще в начале 1970-х годов были переданы Астраханскому музею-заповеднику для проведения музеефикации. Территория бывшей военной крепости также стала заповедной.
Строительство Астраханского каменного кремля было начато в правление Иоанна IV Грозного в 1582 году, а завершено в правление его сына царя Федора Иоанновича при непосредственном участии Бориса Годунова. Астраханский кремль — уникальный образец военно-инженерного искусства второй половины XVI века, архитектурный памятник федерального значения. Его стены и башни Пыточная, Житная, Крымская построены в XVI веке из татарского кирпича (плинфы), привезенного с развалин столицы Золотой Орды Сарая-ал-Махруса.
Долгое время кремль был неприступной твердыней на южной границе Русского государства. В нем были возведены и чудом уцелели в пору лихолетий каменные православные храмы. Сегодня в городах России сохранилось лишь 13 аналогичных памятников русского средневековья. Многое повидали за прошедшие столетия кремлевские стены и башни: строгие военные парады и кровавые народные восстания, встречу царственных особ и пышные праздничные богослужения. Артиллерийский двор кремля является местом открытого показа реконструкции осадных орудий XVIII- XIX вв., здесь регулярно проводятся кремлевские вечера, в которых принимают участие творческие коллективы министерства культуры, а также интерактивные мероприятия музея.