Дом — музей Б.М. Кустодиева был открыт 15 мая 2002 года. История его создания такова.
Дом (согласно историческим архивным документам) располагался в 4 участке 12 околотка г. Астрахани, на пересечении улиц Биржевой и Запасной.
В 1873 году участок принадлежал купцу Конону Матвеевичу Моисееву. На нем располагался деревянный дом со службами. В 1883 году хозяину было выдано разрешение на постройку деревянного флигеля и лавки на каменном фундаменте. Через 4 года (в 1887г.) была разрешена пристройка к дому каменных двухэтажных служб и галереи.
В начале ХХ века владение перешло к сыну купца Моисееву Ивану Кононовичу, которому в 1902 г. было выдано разрешение на постройку каменного двухэтажного дома в нежилым подвалом. По документам 1912г. известно, что в это время дом принадлежит купцу Злобину.
Есть также информация о том, что в последние годы перед революцией 1917г. часть дома использовалась в качестве типографии.
Во дворе дома был построен деревянный флигель, в котором некоторое время проживала семья Кустодиевых (после 1900г. мать Екатерина Прохоровна и сестра Екатерина). В 1890 году в этом доме проживали также сестры Шавердовы — Александра и Надежда. Известно, что Александра Степановна была крестной матерью Бориса Кустодиева, которую он неоднократно навещал.
С 1990 г. силами местной реставрационной мастерской велись реставрационные работы дома, который поставлен на охрану как памятник истории. В 2002г. последние работы были проведены на средства организации «Астраханьгазпром». 15 мая 2002г. музей открыл свои двери для посетителей.