Фонд музея составляют почти 6 тысяч единиц хранения. Большое количество предметов передано жителями города: посуда, одежда, документы, игрушки и т.д. Данные коллекции очень ценны тем, что являются не просто носителями и свидетелями истории в целом, а «жили» именно в нашем городе, что полностью совпадает с миссией музея: показывать историю развития Барнаула через его жителей.
Экспозиционный комплекс музея состоит из 12 тематических залов, отражающих историко-культурные процессы на территории Алтая от скифских времен до сегодняшнего дня. Музей осуществляет большую просветительскую деятельность, направленную на расширение культурного пространства в Алтайском крае, являясь одним из организаторов популяризации достижений в области культуры и искусства Алтая.