Профиль музея — историко-краеведческий. Располагаясь в одноименном памятнике архитектуры XIX века и в то же время являясь городским музеем, музей ведет свою деятельность в следующих направлениях:
комплектование коллекции бытовых предметов жителей Кенигсберга конца XIX — начала XX века,
изучение и популяризация истории города Кенигсберга конца XIX — начала XX века,
сохранение, реставрация и популяризация памятника архитектуры XIX века «Городские ворота „Фридландские“ с предмостными укреплениями»,
координация деятельности в регионе по изучению и популяризации памятников фортификационного искусства путем проведения ежегодной международной научно-популярной конференции «Оборонительные сооружения Европы и Восточной Пруссии» (время проведения — октябрь),
координация ежегодного межмузейного (около 13 участников) проекта «Музейная ночь в Калининграде» (время проведения — май).
В своей экспозиционно-выставочной работе музей делает упор на инновационные практики музейного дела — активное (но уместное) использование мультимедийных средств — в музее создана постоянная экспозиция «Виртуальные прогулки по старому Кенигсбергу», не имеющая аналогов в Европе и России.
Еще одним из приоритетных и активно развивающихся направлений деятельности музея является музейная педагогика, основывающаяся на активном использовании интерактивных программ для работы с дошкольниками и школьниками.
