Музей открыт 1 мая 1964 года. Сейчас он размещается в одном из старейших зданий города, построенном на рубеже XIX-XX вв. Первоначально в нем размещалась греческая школа.
В экспозиции музея нашли свое отражение многие страницы истории района. Время образования древнегреческого рабовладельческого государства Боспор, эпоху средневековья. Поражает красотой зал «Природы» — красочные диорамы рассказывают о флоре и фауне района. Коллекция предметов этнографии, расположенная в зале «Краеведение» рассказывает об истории заселения Крымского района. Отдельный зал музея посвящен событиям Великой Отечественной войны. Центральный участок «Голубой линии» — вражеского оборонительного рубежа, последнего и самого мощного укрепления фашистов на Кавказе — находился на территории Крымского района.