Музей обладает уникальной коллекцией художественного стекла, основу которой составили произведения ведущего стекольного предприятия Советского Союза Ленинградского завода художественного стекла.
Экспозиция занимает четыре зала: Центральный, Чёрный, Белый залы и зал «Северная анфилада». Центральный и Чёрный залы — это постоянная экспозиция произведений из фондов Елагиноостровского дворца-музея. Белый зал предназначен для временных выставок.
Фонд «Стекло» Елагиноостровского дворца-музея пополняется новыми произведениями ежегодно.
В 2018 году на базе Музея художественного стекла создана Стеклодувная мастерская, являющаяся единственной в России мастерской, которая показывает технологии горячей обработки стекла и занимается обучением всех желающих.