К 1 января 2014 года в основном фонде музея 9 648 единиц хранения, в научно-вспомогательном 4 541. Характер коллекций разнородный, так как музей создавался буквально на пустом месте и всем миром, но именно в этом и состоит его “изюминка”.
Тогда же определилось два основных направления в формировании собрания: художественное и историко-краеведческое: ведь Богородицкий музей это и музей-усадьба, и художественный музей, и историко-краеведческий.